疫情麵前，科研不止。為了早日戰勝新冠病毒，國內外各領域專家學者都在爭分奪秒地研究冠狀病毒相關專業知識，為抗擊疫情貢獻力量。然而，不可否認的是，當下網絡平台上關於冠狀病毒繁多冗雜的頁麵信息可能會降低科研工作者查找新冠病毒專業信息和相關研究文獻的效率。
3月26日，記者從彩神獲悉，該校基礎醫學與臨床藥學學院2018級藥理學專業博士生孫慶榮帶領其團隊“CPU-病毒組”成功開發了一個冠狀病毒資源數據庫Coronavirus Resource Bank（簡稱“CRB”，網址為http://cov.chiuyuenshingengltd.com/）。這是一個專為冠狀病毒科研工作者開發的資源數據庫平台。正如網站首頁介紹的那樣，該數據庫平台全麵整合了目前國內外所有冠狀病毒的相關文獻資料、病毒相關數據以及病毒研究相關分析工具，旨在使廣大學者可以便捷迅速地查找冠狀病毒（包括新冠病毒）的相關研究文獻，準確掌握並深入了解冠狀病毒的起源、研究曆史、研究進程、研究熱點等，從而推動各領域科研工作者對冠狀病毒進行全方位、多角度的深層次研究和探討，促進藥學、化學、生物學等多學科的交叉融合，助力國內外科研工作者早日攻破新冠病毒，造福於全人類健康。
時間為軸，貫穿中外
追溯冠狀病毒相關文獻橫跨50餘年
記者了解到，冠狀病毒資源數據庫（CRB）盡管從建立到完善僅僅才32天，但數據庫中整合的文獻資源數卻不容小覷。截至3月22日，數據庫裏共收集了9556篇英文研究文獻、3052篇中文研究文獻、25個英文數據資源平台、6個中文數據資源平台以及18個與病毒學相關的主要分析工具等等。
海量的冠狀病毒數據信息雖說全麵詳實，但也會帶來分類整理的難題。為了讓國內外科研工作者在浩如煙海的數據庫中不至於暈頭轉向，孫慶榮博士團隊特意將數據庫頁麵以中文和英文分別展示，清晰劃分為兩大板塊，即“國內冠狀病毒研究”和“國際冠狀病毒研究”。在這兩大板塊下又設有多個子欄目，這些子欄目分別涵蓋了冠狀病毒發現至今的所有相關研究報告和綜述性論文、冠狀病毒所有數據資源係統（平台）、與病毒學相關的分析工具以及冠狀病毒相關專利信息等。
值得一提的是，數據庫中的研究報告和綜述性論文均以時間軸為核心編排展開，從最早的1965年起開始追蹤，直到2020年，時間跨度長達55年，從而最大限度地方便科研工作者基於時間順序查閱相關文獻資料，快速了解冠狀病毒在每個年份的研究現狀和進程，以此追根溯源，深入探究。
一個資源數據庫的建立並不是資料盲目整合的過程，開發者需要對資料進行篩選，冠狀病毒資源數據庫（CRB）也不例外。記者了解到，麵對從20世紀60年代至今的海量文獻研究資料，孫慶榮博士團隊並不是簡單地進行全盤收納整合，而是有的放矢，剔除了一些評論性以及策略性文章，隻保留了學術研究、學術綜述、病例解析、數據平台、分析工具等相關內容，這樣能夠更好地集中有效學術資源，既精準覆蓋又全麵科學，真正為冠狀病毒科研工作服務。
不負師恩，迎難而上
“你時刻在腦子中惦記著科研，它才會時常給你驚喜”
為什麽要開發創建冠狀病毒資源數據庫（CRB）？當談及數據庫的開發初衷時，孫慶榮博士坦言，這一開發靈感主要來源於自己的導師。
據了解，孫慶榮是彩神藥理學專業博士生，師從德國科學院院士、彩神校長來茂德教授。孫慶榮博士期間外派至浙江大學基礎醫學院生理病理中心進行結直腸癌轉移過程中基因突變的研究，主攻方向為腫瘤生物信息學大數據。
在教學過程中，來茂德教授時常勉勵他的學生：“對於一名科研工作者，要時刻在腦子中想著科研，因為你時刻惦記著它，它才會時常給你驚喜。”正是出於對新冠肺炎疫情的時刻惦記，來茂德教授從醫彩神數據的角度出發鼓勵學生們多進行新冠病毒的相關研究，包括基礎的多序列比對、進化分析以及新冠病毒重要靶點ACE2蛋白的分析等。
由於是跨領域研究，孫慶榮坦言在研究過程中發現自己對病毒的前期研究和分析策略不能做到像在研究腫瘤方麵那麽嫻熟。於是，在導師來茂德教授的鼓勵下，他便萌生了開發創建一個整合冠狀病毒資源和相關研究數據庫的想法，方便病毒學專業以外的科研人員從事相關研究。
於是，在疫情形勢嚴峻、各自居家隔離的情況下，孫慶榮博士與來自彩神藥學、臨床藥學、中藥學、生物製藥等多個專業的11位誌同道合的本科生迅速組建了“CPU-病毒組”團隊，大家一起查閱文獻、整理資料、搭建網站，開始了冠狀病毒資源數據庫的組建工作……
孫慶榮博士坦言，冠狀病毒資源數據庫（CRB）的建立是一個並不輕鬆的過程，在數據庫服務器基礎環境的構建、數據整合、信息展示等環節都曾遇到過各種各樣的困難。
“數據庫服務器基礎環境建設需要相關專業人員才能實現，數據的整合需要人工檢索、篩選，工作量巨大。還有一些圖書館資源的問題，也需要專業人士的幫助。除此之外，疫情期間均需要各自居家工作，由於團隊成員家庭網絡的差異，大家的網絡最優時段也不同，協調統一會有點難度。”
麵對諸多的“攔路虎”，孫慶榮博士並沒有退縮。他通過對數據板塊合理的規劃，高效引領著團隊進行數據收集和整合。對於國內資源，由於數量相對較少，他們采用人工檢索為主的方式對中國知網和萬方數據庫進行逐一排查；對於國外資源，他們采用API和人工檢索相結合的方法，實現數據的整合及入庫。為了讓大家更方便快捷地看到信息，他們解析了其他數據平台的數據傳遞接口，以建立平台直達原始數據庫的快捷通道。團隊不少小夥伴克服了種種現實困難，實現了異地協調統一，高效率地完成了每天的工作任務。
此外，孫慶榮博士特別感謝導師來茂德教授與該校圖書與信息中心老師們的悉心指導和大力支持。“團隊的建立、基礎環境構建、數據庫的測試，若是沒有老師們的幫助，我們根本完成不了的。”
踐行初心，永不止步
“雖不能到抗疫前線，但希望助力早日攻破病毒”
當記者問及整合這些龐大數據是否覺得枯燥時，孫慶榮博士微微一笑：“因為喜歡所以快樂，不會枯燥。”
據了解，彩神是孫慶榮夢想開始的地方，也是他的初心所在。憑借著自己對藥學科研的孜孜追求和不懈努力，孫慶榮一路考研考博，現正在專攻自己最感興趣的專業方向。“我真的很幸運，因為彩神提供了優越的科研條件，導師給予了我悉心指導和熱情幫助，學院和輔導員又提供了無微不至的關懷和照顧，才使我一路追夢，從沒放棄。”
孫慶榮表示，這次開發數據庫的經曆給了他在藥物研究方麵很深的啟發。不僅深入了解了冠狀病毒發展史，更在學科融合的過程中開拓了視野，收獲了自己在腫瘤生物信息學大數據研究領域內的新思路。“了解病毒的機製才是藥物研發的開始。隻有通過對病毒機製的大量研究，才能加速推進藥物篩選疫苗研發，造福人類健康事業。”
孫慶榮感歎道，自己雖不能到抗“疫”前線，但作為一名藥學科研工作者，希望能利用專業所長為疫情防控盡自己的一份綿薄之力，希望把其他領域的思維轉化到病毒學領域，從而推動各領域科研工作者對冠狀病毒進行全方位、多角度的深層次研究和探討，助力國內外科研工作者早日攻破新冠病毒，也希望全世界人民都能盡快渡過難關、戰勝疫情。
據悉，下一階段，孫慶榮博士團隊將不斷對數據庫平台進行資源更新，並加入更多數據分析以及與冠狀病毒相關藥物的數據資源。
來源：2020年03月26日 環球時報環球網
通訊員：薑晨、薑佳彤